Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VWC2Q2TAL6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms