Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TSR1Q2NL82 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms