Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERCC6LQ2NKX8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms