Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX7Q2KHR2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms