Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GEN1Q17RS7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms