Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK4Q16654 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK4Q16654 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK4Q16654 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK4Q16654 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK4Q16654 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK4Q16654 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK4Q16654 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK4Q16654 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK4Q16654 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK4Q16654 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK4Q16654 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDK4Q16654 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK4Q16654 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK4Q16654 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDK4Q16654 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDK4Q16654 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK4Q16654 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK4Q16654 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDK4Q16654 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK4Q16654 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK4Q16654 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK4Q16654 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK4Q16654 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK4Q16654 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDK4Q16654 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDK4Q16654 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK4Q16654 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDK4Q16654 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK4Q16654 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK4Q16654 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK4Q16654 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK4Q16654 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK4Q16654 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK4Q16654 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK4Q16654 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK4Q16654 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK4Q16654 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK4Q16654 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK4Q16654 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK4Q16654 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
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PDK4Q16654 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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PDK4Q16654 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PDK4Q16654 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PDK4Q16654 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PDK4Q16654 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PDK4Q16654 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PDK4Q16654 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PDK4Q16654 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PDK4Q16654 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PDK4Q16654 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PDK4Q16654 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PDK4Q16654 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PDK4Q16654 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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