Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFIL3Q16649 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms