Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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GABRA6Q16445 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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