Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALX1Q15699 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALX1Q15699 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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