Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3CQ15386 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE3CQ15386 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms