Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCAPQ14761 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms