Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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IRF3Q14653 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF3Q14653 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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