Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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