Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPARCL1Q14515 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPARCL1Q14515 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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