Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOFQ13790 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOFQ13790 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOFQ13790 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOFQ13790 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOFQ13790 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOFQ13790 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOFQ13790 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
APOFQ13790 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOFQ13790 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOFQ13790 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOFQ13790 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOFQ13790 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOFQ13790 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOFQ13790 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOFQ13790 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOFQ13790 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOFQ13790 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOFQ13790 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
APOFQ13790 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOFQ13790 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOFQ13790 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOFQ13790 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
APOFQ13790 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOFQ13790 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOFQ13790 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOFQ13790 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOFQ13790 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOFQ13790 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOFQ13790 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOFQ13790 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOFQ13790 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOFQ13790 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOFQ13790 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
APOFQ13790 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOFQ13790 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
APOFQ13790 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
APOFQ13790 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOFQ13790 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOFQ13790 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOFQ13790 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOFQ13790 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOFQ13790 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOFQ13790 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOFQ13790 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOFQ13790 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOFQ13790 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOFQ13790 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOFQ13790 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOFQ13790 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOFQ13790 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOFQ13790 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOFQ13790 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOFQ13790 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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