Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTMR1Q13613 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR1Q13613 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR1Q13613 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR1Q13613 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR1Q13613 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR1Q13613 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR1Q13613 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR1Q13613 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR1Q13613 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR1Q13613 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR1Q13613 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR1Q13613 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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