Protein–RNA interactions for Protein: Q13561

DCTN2, Dynactin subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN2Q13561 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN2Q13561 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN2Q13561 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms