Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LSAMPQ13449 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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