Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SF3B2Q13435 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
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