Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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