Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF1Q13351 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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