Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP140Q13342 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP140Q13342 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP140Q13342 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP140Q13342 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP140Q13342 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP140Q13342 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP140Q13342 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SP140Q13342 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP140Q13342 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP140Q13342 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP140Q13342 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP140Q13342 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP140Q13342 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP140Q13342 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP140Q13342 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP140Q13342 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP140Q13342 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP140Q13342 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP140Q13342 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SP140Q13342 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP140Q13342 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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SP140Q13342 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP140Q13342 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP140Q13342 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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SP140Q13342 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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SP140Q13342 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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SP140Q13342 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SP140Q13342 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SP140Q13342 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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SP140Q13342 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SP140Q13342 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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SP140Q13342 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SP140Q13342 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SP140Q13342 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SP140Q13342 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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SP140Q13342 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SP140Q13342 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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SP140Q13342 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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SP140Q13342 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SP140Q13342 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SP140Q13342 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SP140Q13342 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP140Q13342 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP140Q13342 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP140Q13342 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP140Q13342 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP140Q13342 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP140Q13342 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP140Q13342 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP140Q13342 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP140Q13342 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP140Q13342 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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