Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms