Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERCC8Q13216 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ERCC8Q13216 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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