Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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