Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HSPB3Q12988 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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