Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BNIP3Q12983 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP3Q12983 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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