Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX4Q12846 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX4Q12846 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STX4Q12846 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX4Q12846 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX4Q12846 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX4Q12846 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX4Q12846 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX4Q12846 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX4Q12846 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX4Q12846 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX4Q12846 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX4Q12846 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
STX4Q12846 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX4Q12846 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX4Q12846 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX4Q12846 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX4Q12846 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX4Q12846 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX4Q12846 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
STX4Q12846 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX4Q12846 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX4Q12846 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX4Q12846 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX4Q12846 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STX4Q12846 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STX4Q12846 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STX4Q12846 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STX4Q12846 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STX4Q12846 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STX4Q12846 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STX4Q12846 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STX4Q12846 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STX4Q12846 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STX4Q12846 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STX4Q12846 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STX4Q12846 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STX4Q12846 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STX4Q12846 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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