Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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KCNH2Q12809 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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KCNH2Q12809 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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KCNH2Q12809 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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KCNH2Q12809 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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KCNH2Q12809 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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KCNH2Q12809 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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KCNH2Q12809 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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