Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPAL4Q0D2K0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms