Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms