Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC3A1Q07837 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms