Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX4Q06945 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms