Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX8Q06710 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms