Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNG1Q06432 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms