Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSME1Q06323 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms