Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms