Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN1Q04323 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms