Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms