Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSC2Q02487 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms