Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MC1RQ01726 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MC1RQ01726 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms