Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEFA6Q01524 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms