Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA5Q01523 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA5Q01523 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms