Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms