Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCCQ00597 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms