Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAMQ00059 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms