Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRB1P82279 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRB1P82279 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRB1P82279 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRB1P82279 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRB1P82279 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRB1P82279 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRB1P82279 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRB1P82279 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRB1P82279 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRB1P82279 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRB1P82279 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRB1P82279 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRB1P82279 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRB1P82279 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRB1P82279 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRB1P82279 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRB1P82279 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRB1P82279 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRB1P82279 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRB1P82279 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRB1P82279 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRB1P82279 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRB1P82279 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRB1P82279 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRB1P82279 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRB1P82279 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRB1P82279 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRB1P82279 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRB1P82279 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRB1P82279 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRB1P82279 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRB1P82279 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRB1P82279 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRB1P82279 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CRB1P82279 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRB1P82279 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRB1P82279 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRB1P82279 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRB1P82279 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRB1P82279 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CRB1P82279 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRB1P82279 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRB1P82279 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRB1P82279 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRB1P82279 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRB1P82279 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRB1P82279 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CRB1P82279 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRB1P82279 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRB1P82279 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRB1P82279 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CRB1P82279 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CRB1P82279 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRB1P82279 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRB1P82279 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRB1P82279 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRB1P82279 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRB1P82279 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRB1P82279 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRB1P82279 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRB1P82279 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRB1P82279 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CRB1P82279 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRB1P82279 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CRB1P82279 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRB1P82279 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CRB1P82279 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRB1P82279 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRB1P82279 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRB1P82279 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRB1P82279 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRB1P82279 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRB1P82279 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRB1P82279 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRB1P82279 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRB1P82279 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRB1P82279 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRB1P82279 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRB1P82279 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRB1P82279 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRB1P82279 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRB1P82279 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRB1P82279 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRB1P82279 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRB1P82279 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRB1P82279 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRB1P82279 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRB1P82279 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms