Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFI35P80217 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFI35P80217 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFI35P80217 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFI35P80217 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFI35P80217 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFI35P80217 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFI35P80217 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFI35P80217 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFI35P80217 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFI35P80217 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFI35P80217 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFI35P80217 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFI35P80217 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFI35P80217 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFI35P80217 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFI35P80217 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFI35P80217 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFI35P80217 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFI35P80217 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFI35P80217 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFI35P80217 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFI35P80217 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFI35P80217 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFI35P80217 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFI35P80217 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFI35P80217 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFI35P80217 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFI35P80217 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFI35P80217 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFI35P80217 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFI35P80217 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFI35P80217 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFI35P80217 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFI35P80217 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFI35P80217 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFI35P80217 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFI35P80217 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFI35P80217 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms