Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ELF3P78545 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ELF3P78545 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ELF3P78545 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ELF3P78545 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ELF3P78545 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ELF3P78545 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ELF3P78545 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ELF3P78545 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ELF3P78545 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ELF3P78545 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ELF3P78545 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELF3P78545 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELF3P78545 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELF3P78545 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELF3P78545 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELF3P78545 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELF3P78545 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELF3P78545 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELF3P78545 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ELF3P78545 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELF3P78545 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELF3P78545 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELF3P78545 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELF3P78545 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELF3P78545 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ELF3P78545 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELF3P78545 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELF3P78545 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ELF3P78545 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELF3P78545 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELF3P78545 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELF3P78545 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELF3P78545 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELF3P78545 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELF3P78545 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELF3P78545 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELF3P78545 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELF3P78545 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELF3P78545 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELF3P78545 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELF3P78545 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELF3P78545 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELF3P78545 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELF3P78545 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms