Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX6P78412 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX6P78412 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX6P78412 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX6P78412 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX6P78412 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX6P78412 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX6P78412 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX6P78412 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX6P78412 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX6P78412 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX6P78412 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX6P78412 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX6P78412 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX6P78412 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX6P78412 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX6P78412 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX6P78412 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX6P78412 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX6P78412 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX6P78412 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX6P78412 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX6P78412 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX6P78412 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX6P78412 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX6P78412 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX6P78412 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX6P78412 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX6P78412 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX6P78412 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX6P78412 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX6P78412 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX6P78412 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX6P78412 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX6P78412 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX6P78412 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX6P78412 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX6P78412 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
IRX6P78412 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
IRX6P78412 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IRX6P78412 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
IRX6P78412 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRX6P78412 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRX6P78412 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRX6P78412 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRX6P78412 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRX6P78412 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
IRX6P78412 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRX6P78412 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRX6P78412 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRX6P78412 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRX6P78412 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX6P78412 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX6P78412 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX6P78412 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX6P78412 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX6P78412 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX6P78412 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX6P78412 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX6P78412 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX6P78412 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX6P78412 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX6P78412 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX6P78412 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX6P78412 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX6P78412 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX6P78412 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX6P78412 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX6P78412 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX6P78412 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX6P78412 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX6P78412 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX6P78412 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX6P78412 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX6P78412 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX6P78412 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX6P78412 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX6P78412 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX6P78412 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX6P78412 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX6P78412 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX6P78412 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX6P78412 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX6P78412 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms